Gonokokker trives på slimhinner, og blir oftest funnet i kjønnsorganer, urinrør, endetarm og hals. Bakterien kan også spres til blod og andre av kroppens organer, og kan gi betennelse i disse.

Hos de aller fleste menn gir gonoré i urinrøret symptomer etter to til fem dager, men ikke alle menn får ubehag. Det oppstår svie ved vannlating og utflod fra urinrør, ofte rikelig ("dryppert"). Hos menn kan gonoré spre seg til bitestiklene og føre til sterilitet. 

Kvinner kan ha lignende symptomer som menn, og i tillegg utflod fra skjeden og uregelmessige blødninger. Symptomene er svakere, iblant så lite uttalte at de ikke merkes. Hos kvinner kan gonoré spre seg til egglederne og føre til sterilitet. Hvis en kvinne har gonoré når hun føder, kan barnet påføres øyeinfeksjon.

Infeksjon i hals og endetarm gir oftest ikke plager, hverken hos kvinner eller menn.